氨氮廢水處理技術現已涉及到廣大人民的農業活動、國家環境問題、國民經濟發展、人民生活等各方各面，隨之增加的還有其工作的困難性與復雜性。雖然有了近些年來眾多學者實踐總結出的經驗，但是氨氮廢水處理技術也暴露出了大量問題。 
1、氨氮廢水處理技術人員能力受限 因為傳統氨氮廢水處理技術受限，一個好的技術工作人員在整個氨氮廢水過程中起到的作用仍十分重大。技術工工作的準確性直接影響到工程的進展，甚至工作的成敗。故障產生的一個重要來源表現在對氨氮廢水處理機器的使用過程中產生的偏差，他們不良的甚至錯誤的操作方式，是產生這種誤差的主要原因，例如操作時時采取的習慣大相徑庭，觀測時選用的角度大相徑庭等。在操作過程中技術人員所造成的誤差也是造成鍛造過程檢定和測量出現差錯的一個重大緣由，對知識的掌握半生不熟、動手實踐能力相對較差、操作流程沒有搞明白等都可找到端疑，此外對儀器進行校準也會使實驗結果產生較大偏差。不管科學技術發展到何種水平，人在其中的作用仍是至關重要的不可忽視的，它的作用往往在于統領全局，所以只要人好對人的管理才不至于最后功虧一簣。 2、自身技術受限 隨著工業新時代的來臨，人們的經濟生活水平逐步提高，在追求更高生活標準的同時，對自身生活環境的要求也隨之增加。氨氮廢水處理技術如果技術過于陳舊、處理效率過低不僅會對廢物利用觀念下的污水廠系統專業的發展造成影響，而且對社會中各方面會產生負面的連帶作用。但是由于受到基礎化學和應用化學發展的限制，氨氮廢水處理技術到現在為止仍是一個技術難題。相關理論和技術的發展速度緩慢，甚至停滯不前的原因表現在方方面面。其中主要有兩點十分突出，一方面是基礎物理進展緩慢，氨氮廢水處理技術不達標，發展至今日，傳統化學除污廢水處理工藝仍是應用比較廣的技術，其廢水處理效率及效果已不在滿足生產需求;另一方面，傳統化學除污廢水處理工藝技術耗資巨大，所以導致許多廠家采取不配合的方式，醫用難度較大，到目前為止并沒有給人們帶來十分明顯的利益，也沒有引起人們足夠的重視。新型氨氮廢水處理技術一經提出就得到了國際社會的廣泛關注，人們也對其營造的現代化的能源的由來方式充滿了無盡的向往。到目前為止該設備仍處于初始階段，但其已為人類帶來相應的效益，發展勢頭一片良好。 3、生物氨氮廢水處理技術發展受限 前文提到傳統的氨氮廢水處理技術是當下工廠應用較為廣泛的污水處理系統，但是其在應用過程中暴漏出大量的問題，其中有兩個方面較為突出，一方面，傳統氨氮廢水處理技術理論技術受限，造成處理效率過低的問題，即使工廠都配置了氨氮廢水處理系統，其處理后的廢水人股能達到國家的廢水排放標準;另一方面，廢水處理技術步驟過于繁雜，工廠如果配置一整套的污水處理系統，將要引進大量的機械設備，其將會占用大量的工廠建設面積，廢水處理費用也會成為工廠的一項較大開支，這會引起企業工廠的排斥反應，國建監管難度較大。生物氨氮廢水處理技術是時下比較先進的包括氨氮廢水處理在內的污水處理系統，他是生物學上的一個理論突破，為更為有效的廢水處理提供可一個新的思路，但是當下該理論仍處于初步實行階段，相關的應用受到極大的限制。
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