我們常說水中的總氨來源于含氮有機物的分解，這可能構成了大量投喂池塘的水中總氨源的大部分，氨是水生動物排泄物(糞便)和底層有機物氨化產生的。氨對水生動物來說是一種劇毒物質。因為動物糞便，養殖池塘里一定有氨。養殖密度越高，氨的濃度越高。但就其對魚類的毒性而言，魚類是否被氨毒害，取決于魚體內氨的水平。 在許多魚塘，由于水條件差，很難加水或換水。在水產養殖的中后期，池塘，魚類數量較多，餌料數量不斷增加。在魚塘(尤其是秋季)，氨氮往往嚴重超標，魚塘部分地區可能發生氨中毒特別是在魚類生長旺季的密集魚塘，由于餌料量大，排餌和殘餌多，加之氣溫較高，有機物氧化分解產生的含氮物質也隨之增多。
池塘的氨氮主要來源于四種途徑：魚蝦蟹糞便、肥料、殘餌和動植物尸體的分解，以及地下污泥水中的氨氮。 水中氨氮來源與含氮化合物的轉化：氨氮對水生動物的危害。氨氮對水生動物的危害可分為急性和慢性。慢性氨氮中毒的危害是食物攝入減少、生長緩慢、蛻皮不成功、組織損傷和組織間氧氣轉運減少。魚、蝦、蟹都需要與水進行離子交換。氨氮會增加鰓絲的通透性，破壞鰓的離子交換功能，使水生生物長期處于應激狀態，增加動物疾病的易感性。最常見的是會導致河蟹爛鰓、黑鰓病，減緩生長速度，最終死亡。氨對魚的毒性很強，是亞硝酸鹽的十倍。在非常低的濃度下，許多魚會中毒甚至死亡。氨對魚的毒性隨濃度和魚的不同而不同。急性氨氮中毒的特點是水生生物多動，水中失去平衡和抽搐，嚴重者甚至出現氨氮和亞硝酸鹽死亡。原因： (1)池底淤泥較深，水質老化； (2)高密度放養和高強度飼養； (3)水質稀薄，水中浮游植物和有益藻類稀少； (4)池塘注入污染水。
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